Пояснення: чому дельта-варіант Covid-19 поширюється швидше, ніж інші штами

Більше людей, інфікованих дельта-варіантом Covid-19, швидше за все, передадуть інфекцію іншим, перш ніж вони навіть підозрюють, що можуть бути хворі.

Продавець, який носить маску для обличчя, як запобіжний захід проти коронавірусу, виставляє іграшки на продаж на пляжі Форт-Кочі в Кочі, штат Керала, понеділок, 23 серпня 2021 року. (AP Photo: R S Iyer)

Оскільки вчені стикаються з часом, щоб знайти біологічну основу для передачі Дельта варіант Covid-19 кілька нових досліджень виявили, що ключові мутації зниження ефективності вакцин , а також висока інфекційність у пацієнтів на передсимптоматичній фазі є однією з основних причин швидкого поширення.

Останні епідеміологічні дослідження показують, що дельта-варіант (B.1.617.2) передається щонайменше на 40 відсотків більше, ніж варіант альфа, вперше виявлений у Великобританії наприкінці 2020 року. Крім того, з численні дослідження демонструючи знижену ефективність вакцини проти варіанту Delta, повністю вакциновані особи також залишаються вразливими до проривні інфекції .

Голова ВООЗ Тедрос Адханом Гебрейесус на брифінгу раніше заявив, що Delta є найбільш переданим варіантом, виявленим на сьогодні, і він швидко стає домінуючий штам Covid-19 у багатьох країнах. Згідно з внутрішньою презентацією, поширеною в Центрах контролю та профілактики захворювань США (CDC), варіант Delta є більш трансмісивний ніж віруси, що викликають MERS, SARS, Ебола, звичайну застуду, сезонний грип та віспу, і вона принаймні настільки ж заразна, як і вітряна віспа.

Джерело: JHU CSSE та covariants.org

Чому варіант Дельта більш заразний?

Нещодавні дослідження показують, що ключова мутація амінокислот може лежати за лютою інфекційністю варіанту Delta.

Команда дослідників під керівництвом вірусолога Медичного відділу Техаського університету Пей-Йонг Ши зосередилася на ключовій мутації, яка змінює одну амінокислоту в білку SARS-CoV-2. Зміна називається P681R і перетворює залишок проліну в аргінін, згідно зі звітом про дослідження, опублікованим в журналі Nature. Зміна відбувається в місці розщеплення фурину білка шипа.

Щоб проникнути в клітини, білок-шип SARS-CoV-2 повинен бути двічі розрізаний білками-господарями. Місце розщеплення фурину в Covid-19 є важливим, оскільки це означає, що ферменти-господарі, включаючи фурин, можуть зробити перший розріз. Після цього з інфікованої клітини виходять новоутворені вірусні частинки, які можуть інфікувати клітини-господаря більш ефективно.

Альфа-варіант також містить мутацію в тому ж місці, хоча він містить зміну в іншій амінокислоті. У дослідженні стверджується, що у випадку Delta мутація, яка змінює розщеплення фурину, мала глибокий ефект.

У попередньому роздруківці дослідження, яке було нещодавно доступне, дослідники заявили, що білок-шип вирізається набагато ефективніше в частинках дельта-варіанту, ніж у альфа, при цьому мутація P681R значною мірою відповідає за ефективне відсікання шипа.

У дослідженні зазначено, що мутація P681R є ключем до високої інфекційності та швидкої передачі варіанту Delta. Дослідники виявили, що в інфікованих культивованих епітеліальних клітинах дихальних шляхів людини варіанти Delta поширюються швидше, ніж Альфа. Але коли дослідники видалили мутацію P681R, різниця в швидкості передачі була втрачена.

Дослідження перегукується з результатами дослідження, проведеного командою під керівництвом Кей Сато, вірусолога з Токійського університету, яка виявила, що спайкові білки, які несуть P681R, можуть зливатися з плазматичними мембранами неінфікованих клітин майже в три рази швидше, ніж при мутації. відсутня.

Джерело: CoVariants.org та GISAID через Наш світ в даних

Чи інші ключові мутації також відповідають за швидку передачу Дельти?

Вчені стверджують, що варіант Delta має кілька ключових мутацій, і зміна P681R, хоча й суттєва, навряд чи є єдиною причиною, що сприяє його швидкому передачі.

Дослідники з Уганди заявили, що зміна P681R була присутня у варіанті, який широко поширився в країні на початку 2021 року, але не виявилося настільки заразним, як Delta. The Варіант каппа , брат Дельти, який був ідентифікований в Індії, також мав таку ж мутацію, але дослідники виявили, що його шипковий білок розщеплюється рідше і менш ефективно зливається з клітинними мембранами.

Попередні дослідження показали, що інші ключові мутації у варіанті Delta, такі як L452R і D6146, дозволяють вірусу міцніше прикріплюватися до рецепторних клітин і легше позбутися імунітету.

Фактично, варіант Delta має множинні мутації в субодиниці S1 білка спайка, включаючи три в домені зв’язування рецептора, що покращує його здатність зв’язуватися з рецепторами ACE2 і ухилятися від імунної системи організму.

Я думаю, що вірус досягає успіху за обсягом і швидкістю. Він став набагато ефективнішим вірусом. Він проходить через людей і проходить через клітини набагато швидше, сказав Nature Гері Віттакер, вірусолог з Корнельського університету.

Віттакер також сказав, що дослідження підкреслило важливість мутацій у місці розщеплення фурину коронавірусу. Він також додав, що P681R не буде останньою мутацією сайту розщеплення фурину, яка викликає занепокоєння.

Джерело: CoVariants.org та GISAID через Наш світ в даних

Чому так важко зупинити поширення варіанту Delta?

Однією з інших причин швидкого поширення дельта-варіанту, як було виявлено під час дослідження в Гуанчжоу, Китай, є надзвичайно високий рівень інфекційності пацієнтів навіть у досимптоматичній фазі. Це означає, що люди знаходяться під загрозою поширення вірусу, навіть не підозрюючи, що вони можуть бути заражені.

Недавнє дослідження Бенджаміна Коулінга, епідеміолога з Університету Гонконгу та його колег, показало, що симптоми у людей почали з’являтися через 5,8 дня після зараження Delta — через 1,8 дня після того, як вони вперше дали позитивний результат на вірусну РНК. Таким чином, це створює небезпечне вікно для передачі вірусу.

Іншими словами, оскільки поява симптомів відбувається пізніше, більше людей, інфікованих дельта-варіантом, швидше за все, передадуть інфекцію іншим навіть до того, як вони навіть підозрюють, що можуть бути хворі.

Дослідження показало, що 74% інфекцій Delta мали місце під час досимптомної фази. Дослідники також виявили, що R-нуль, або основне число відтворення, яке представляє в середньому кількість людей, яким можна очікувати, що одна інфікована людина може передати цю хворобу, для Delta становить 6,4. Щоб розглянути речі в перспективі, R-ноль штаму Ухань, згідно з кількома дослідженнями, проведеними раніше, був від 2 до 4.

Чи викликає занепокоєння зниження ефективності вакцини проти Delta?

Декілька досліджень виявили, що ефективність вакцин знижена проти варіанту Дельта, що, у свою чергу, робить повністю вакцинованих осіб вразливими до проривних інфекцій.

Раніше дослідження Public Health England виявило, що ефективність вакцини Oxford-AstraZeneca зводиться до 64% проти варіанту Delta . Раніше дослідження, опубліковане в журналі The Lancet, також виявило, що ті, хто був повністю вакцинований вакциною Pfizer, ймовірно, мають більше п'яти разів нижчі рівні нейтралізуючих антитіл проти варіанту Delta в порівнянні з вихідним штамом.

Зовсім нещодавно дані Міністерства охорони здоров’я Ізраїлю показали, що два уколи Pfizer забезпечує 64% захист проти Covid, у той час, коли понад 90 відсотків випадків, про які повідомлялося в країні, були викликані варіантом Delta.

Ще одна проблема, яка викликає занепокоєння, — ефективність вакцин, яка з часом зменшується. Дослідники з Оксфордського університету у Великобританії та Управління національної статистики країни в нещодавньому дослідженні виявили, що ефективність вакцини Pfizer знизилася до 90 відсотків на місяць після прийому другої дози, до 85 відсотків через два місяці і 78% після трьох. Для AstraZeneca пропонований еквівалентний захист становив 67, 65 і 61 відсоток.

Дослідження також виявило, що навіть у повністю вакцинованих людей інфекції, викликані варіантом Delta, викликали пікове вірусне навантаження, яке було подібним до такого у невакцинованих осіб. Дослідження, проведені в США та Сінгапурі, дали подібні результати.

Це означає, що найбільше занепокоєння полягає в тому, що навіть повністю вакциновані люди можуть поширювати дельта-варіант, що дуже ускладнює розрив ланцюга передачі.

У звіті, опублікованому CDC цього місяця, зазначено, що після великих зібрань у пляжному містечку Провінстаун у штаті Массачусетс у штаті було зареєстровано 469 випадків Covid-19, з яких майже три чверті були щепленими.

При аналізі виявилося, що так само, як і у нещеплених, у тих, хто робив уколи, був високий рівень Значення Ct , що вказує на високе вірусне навантаження. Після секвенування геному 133 зразків було встановлено, що 90% випадків викликані варіантом Delta. Після висновків CDC 27 липня ще раз оновив свої рекомендації, і рекомендовані і навіть вакциновані люди повинні носити маски, коли перебувають у районах, де є значний і високий рівень передачі Covid-19.

Поділіться Зі Своїми Друзями: