Пояснення: як працює тест TrueNat
Вірус SARS-CoV-2, який викликає Covid-19, має не ДНК, а молекулу РНК. Процес зворотної транскрипції (RT у RT-PCR) перетворює РНК в молекулу ДНК, перш ніж ген може бути захоплений в тесті.
Тестовий зразок завантажується на чіп TrueNat. (Джерело: Molbio Diagnostics) Кілька тижнів тому Індійська рада медичних досліджень (ICMR) схвалила використання Машини TrueNat , виготовлений компанією з Гоа, для проведення підтверджуючих тестів на захворювання Covid-19. До цього ці апарати, які спочатку були розроблені для виявлення туберкульозу у пацієнтів кілька років тому, у нинішній пандемії коронавірусу використовувалися лише для скринінгу пацієнтів.
Після схвалення ICMR ці машини зараз шукають у ряді штатів, особливо в тих, у яких немає потужної лабораторної мережі, яка потрібна для проведення традиційних тестів RT-PCR. У той час як Уттар-Прадеш має 117 машин для розгортання у всіх своїх 75 районах, Біхар замовив 50 машин. Джаркханд, Чхаттісгарх, Одіша, Телангана, Андхра-Прадеш — усі шукали ці машини, і багато з них уже розгорнуті.
Як працює TrueNat?
Щоб зрозуміти це, потрібно зрозуміти, як працюють традиційні ПЛР-тести. ПЛР – це метод захоплення певного гена з ДНК у зразку мазка та розмноження його за допомогою ряду хімічних процесів, щоб його можна було виявити за допомогою флуоресцентних барвників. Більшість сучасних ПЛР-тестів, які використовуються і для виявлення інших видів вірусів, працюють в режимі реального часу. Результат видно навіть під час ланцюгової реакції.
Вірус SARS-CoV-2, який викликає Covid-19, має не ДНК, а молекулу РНК. Процес зворотної транскрипції (RT у RT-PCR) перетворює РНК в молекулу ДНК, перш ніж ген може бути захоплений в тесті.
TrueNat — це набір RT-PCR на основі чіпа, який працює від батарейок. Спочатку він міг ідентифікувати лише E-ген у вірусі SARS-CoV-2. Це ген, який допомагає вірусу будувати навколо нього сферичну оболонку. На даний момент машини TrueNat використовувалися як скринінговий тест. Зразки, які були виявлені за допомогою E-гена, можна було відправити на підтвердження RT-PCR-тестів у лабораторії. Але тепер нові машини обладнані для виявлення ферменту RdRp, знайденого в РНК вірусу, і, отже, ICMR постановив, що ці тести можна розглядати як підтвердження наявності нового коронавірусу.
Велика відмінність полягає в тому, що апарат є портативним, і тести з ним коштують набагато дешевше, ніж традиційні тести RT-PCR. Це робить його надзвичайно корисним для розгортання у внутрішніх районах та віддалених місцях, звідки збір і відправка мазків для тестування у великих містах є складним завданням. Фактично, ці машини вже розгорнуті в селах північного прибережного поясу штату Андхра-Прадеш і в лісистих районах району Гадчіролі.
Як проводиться тестування?
Після того, як мазок збирають у кіосках, встановлених у цих місцях, або в захисних зонах чи оздоровчих таборах, його занурюють у середовище передачі вірусу, де він нейтралізується. У центрі первинної медико-санітарної допомоги або в сусідній лабораторії його передають в іншу рідину, вірусний лізис, в якому клітини руйнуються, а домішки видаляються. Частина цієї рідини потім переноситься в картридж, який виглядає як сплющена касета зі стрічкою, і вставляється всередину машини, дуже схожої на касетний програвач. Кнопка відтворення активує процес. Всього приблизно за 20 хвилин процес витягує РНК, підписний набір геномних інструкцій, які наказують клітині розмножувати вірус, коли він потрапляє в клітину людини. Цей екстракт РНК потім передається на іншу машину, де рідина виділяється в мініатюрну лунку, яка прикріплена до електронного чіпа, розміром не більше ніж великий палець людини.
У той час як мініатюрний колодязь є місцем, де реагент активує РНК, саме чіп, який подається з усіма розрахунками вірусного навантаження, допомагає виявити, чи є людина носія вірусу чи ні. На відміну від звичайних тестів RT-PCR, у цьому процесі реагенти не вимагають екстремальних температур, а кількість тампона, необхідного для тестування, також значно менша.
Враховуючи, що апарати були розроблені для тестування на туберкульоз, чи потребували вони адаптації для тестування на Covid-19?
Апарат, розроблений компанією Molbio Diagnostics Private Limited з Гоа, спочатку був розроблений для діагностики туберкульозу, який вражає щонайменше мільйон дітей щороку. У результаті щонайменше десятирічних досліджень ці машини були лише нещодавно схвалені Всесвітньою організацією охорони здоров’я (ВООЗ), яка засвідчила, що ці машини показали подібну точність, що й інші схвалені ВООЗ комерційні продукти для цієї мети. Ці машини були готові до використання з квітня цього року.
Саме тоді стався Covid, сказав Шива Срірам, національний менеджер з продажу Molbio Diagnostics, який сидів у виробничому підрозділі Гоа. Туберкульоз потребує раннього виявлення, і тому важливий точний діагноз. На відміну від мікроскопії мазка, яка має точність 50:50, ми хотіли досягти кращої точності й продовжували дослідження. Це були 18 років досліджень…, сказав він.
Серце апарату призначене для виявлення різних видів інфекцій. Для кожної інфекції характерний чіп. Компанії знадобилося 15 днів на розробку чіпа, який мав всю діагностику вірусного навантаження для виявлення коронавірусу.
За словами Шрірама, компанія була зайнята організацією доставки списку вантажоодержувачів, наданого їй Міністерством охорони здоров’я для діагностики туберкульозу. П'ятсот машин були поділені між усіма штатами та союзними територіями. Після цього штати почали самостійно оформляти замовлення. На сьогодні вже заброньовано близько 1000 машин, і ми очікуємо, що в найближчі два місяці буде замовлено ще від 3000 до 4000, сказав він.
Саме Гоа першим придбав новий модифікований апарат для скринінгу на Covid-19. Але штат Андхра-Прадеш використовував його найбільш широко, провівши понад 2,5 лакхів скринінгових тестів.
Попит зріс, коли випадки зараження почали зростати в таких штатах, як Біхар, Уттар-Прадеш та Одіша, оскільки мігранти почали повертатися на другому тижні травня. Машина вже увімкнула опитування від дверей до дверей у багатьох частинах цих штатів.
Як TrueNat порівнюється зі звичайними тестами?
Звичайна RT-PCR вимагає, щоб вилучення та аналіз РНК проводилися у двох різних приміщеннях, обладнаних холодильними камерами та підготовленими експертами, які працюють із обладнанням, розробленим у лабораторії. TrueNat, з іншого боку, призначений в першу чергу для роботи у віддалених місцях і розглядається як «діагностика останньої милі».
Машина портативна, її можна носити в портфелі, працює від батареї від одного заряду на десять годин. За словами Шрірама, восьмигодинна зміна дає 45 тестів, і більшість штатів зараз працюють у три зміни на день. Більшість штатів також замовили чотири ігрових автомати, які дозволяють проводити чотири тести одночасно, сказав він.
Кожен з чотирьох ігрових автоматів коштує понад 13 лакхів рупій, але тестовий набір коштує приблизно 1300 рупій.
Поділіться Зі Своїми Друзями:
