Пояснення: як швидко поширюється новий штам коронавірусу? Чи вплине це на вакцинацію?

Новий штам коронавірусу у Великобританії: Індія та кілька інших країн призупинили польоти до та з Великобританії. Які мутації призвели до появи варіанта коронавірусу, який викликав занепокоєння? Наскільки швидко він поширився? І чи вплине це на вакцинацію?

Рейси з Великобританії скасовуються в аеропорту Куінтрін у Женеві, Швейцарія, 21 грудня 2020 року. (Фото Reuters: Деніс Балібуз)

У понеділок Індія припинено всі рейси з Великобританії та до Великої Британії до 31 грудня на тлі занепокоєння щодо a новий варіант SARS-CoV-2, який там швидко поширюється та зростає. Кілька інших країн також призупинили рейси до Великобританії та ввели обмеження на поїздки.

Які ці проблеми призводять до обмежень на поїздки?

Минулого тижня було виявлено, що новий варіант SARS-CoV-2 став причиною швидкого зростання випадків Covid-19 у Південній та Східній Англії. Його називають VUI (варіант під розслідуванням) 202012/01 або рід B.1.1.7.

Протягом останніх кількох днів, завдяки нашим геномним можливостям світового рівня, ми визначили новий варіант коронавірусу, який може бути пов’язаний із швидшим поширенням на півдні Англії, заявив міністр охорони здоров’я Великобританії Метт Хенкок Палаті громад. 14 грудня. Влада Великобританії вже повідомила Всесвітню організацію охорони здоров'я про такий варіант.

Public Health England (PHE) оголосила, що станом на 13 грудня було виявлено 1108 випадків з цим варіантом, переважно на півдні та сході Англії. PHE працює з партнерами над розслідуванням і планує поділитися своїми висновками протягом наступних 2 тижнів.

Який варіант?

Варіант був ідентифікований під час геномного нагляду COVID-19 Genomics UK (COG-UK), консорціумом, який аналізує дані секвенування геному з Великобританії. COG-UK є найбільшим учасником глобальної бази даних Covid-19 GISAID.

Варіант є результатом множинних мутацій білка-шипа нового коронавірусу SARS-CoV-2, а також мутацій в інших геномних областях вірусу РНК. Попередній аналіз показує, що він більш передається, ніж раніше циркулюючі варіанти. COG-UK ідентифікував одну з цих мутацій як N501Y, у ділянці білка шипа, який зв’язується з ключовим білком у клітині людини, рецептором ACE2. Це було ознакою того, що зміни теоретично можуть призвести до того, що вірус стане більш заразним. За словами консорціуму, зараз намагаються підтвердити, чи сприяє будь-яка з цих мутацій посиленню передачі.

Що ми знаємо про передачу та тяжкість захворювання?

У неділю PHE заявив, що дані секвенування всього геному, епідеміології та моделювання свідчать про те, що новий варіант передається легше, ніж інші штами.

Тим не менш, він також підкреслив, що немає доказів того, що цей варіант з більшою ймовірністю спричинить важке захворювання або смертність. … Але ми продовжуємо розслідування, щоб краще зрозуміти це, – йдеться в ньому. У ньому зазначили, що смертність є відстаючим показником, і він буде постійно контролювати це протягом найближчих тижнів.

У PHE заявили, що поки не знають механізму такого збільшення передачі. Ми знаємо, що мутації в білку спайка, частини вірусу, яка робить його інфекційним, можуть змінити те, як вірус взаємодіє з клітинами людини.

У ньому сказано, що дані показують, що рівень зараження в географічних районах, де циркулює цей конкретний штам, зросли швидше, ніж очікувалося, і дані моделювання продемонстрували, що цей варіант має вищу швидкість передачі, ніж інші варіанти, які зараз циркулюють.

Новий штам коронавірусу у Великобританії: офіцер поліції керує рухом на в’їзді до закритого поромного терміналу в Дуврі, Англія, у понеділок після закриття порту Дувра. (AP Photo)

Наскільки занепокоєння викликає вища передача?

18 грудня Консультативна група з питань загроз нових та нових респіраторних вірусів (NERVTAG), яка консультує уряд Великобританії щодо загрози, яку представляють нові та нові респіраторні віруси, заявила, що новий варіант потенційно може збільшити кількість репродукції захворювання до 0,93. . Він сказав, що має помірну впевненість у тому, що новий варіант демонструє значне збільшення передачі в порівнянні з іншими варіантами.

Проте експертний орган дійшов висновку, що наразі недостатньо даних, щоб зробити будь-який висновок про основний механізм підвищеної передачі, віковий розподіл випадків та тяжкість захворювання. Зазначається, що було виявлено 4 смерті у приблизно 1000 випадках, але потрібна подальша робота, щоб порівняти цей рівень смертності з порівнянними наборами даних.

Розташування мутацій у домені, що зв’язує рецептор спайкового глікопротеїну, підвищує ймовірність того, що цей варіант антигенно відрізняється від попередніх варіантів. Було виявлено чотири ймовірні повторні інфекції серед 915 осіб з цим варіантом, але потрібна подальша робота, щоб порівняти цей рівень повторного зараження з порівнянними наборами даних.

У неділю в короткому звіті про оцінку загроз, опублікованому Європейським центром з профілактики та контролю захворювань, говориться, що філогенетичний аналіз показує, що кластер відрізняється на 29 нуклеотидних замін від оригінального штаму Ухань. Три послідовності з Данії та одна з Австралії, зі зразків, зібраних у листопаді 2020 року, об’єднуються з варіантом у Великобританії, що, швидше за все, вказує на міжнародне поширення, хоча ступінь залишається невідомим.

Новий штам коронавірусу у Великобританії: порт Дувра закривається, оскільки країни ЄС накладають заборону на поїздки з Великобританії. (Фото Reuters)

Але чи не мутував вірус раніше?

Щоразу, коли вірус реплікується та циркулює в популяції людини, мутації відбуваються природним чином, зі швидкістю приблизно від однієї до двох мутацій на місяць у глобальній філогенії.

Насправді, щодо SARS-CoV-2, COG-UK каже, що наразі існує близько 4000 мутацій у білку спайка. Варіант D614G раніше був домінуючим штамом, оскільки він дуже легко поширювався. Ще один штам, який виник у іспанських фермерів, 20A. EU1, швидко поширюється по Європі влітку.

Важко передбачити, чи є будь-яка дана мутація важливою, коли вона вперше з’являється, на тлі постійного виникнення нових мутацій. Зрозуміти їх значення може бути можливим на основі експериментальної роботи, яка показує зв’язок між мутацією і тонкими змінами в біології вірусу. Проте, щоб перевірити ефект багатьох тисяч комбінацій мутацій, знадобиться чимало часу та зусиль, повідомляє COG-UK.

Чи вплине це на розробку вакцини та реакцію на неї?

У неділю влада Великобританії заявила, що подальша лабораторна робота проводиться як пріоритет, щоб зрозуміти це. Наразі немає доказів того, що вакцина Pfizer не захистить людей від нового штаму, сказав PHE.

Поділіться Зі Своїми Друзями: