Пояснення: варіант B.1.617 та сплеск Covid-19 в Індії
Дані секвенування геному показали наявність «подвійного мутанта» в 61% зразків у Махараштрі. Але чи спричиняє цей новий варіант постійний сплеск Індії, можна сказати лише після того, як буде доступно більше даних.
Медичні працівники готують ліжка в банкетному залі Shehnai в Нью-Делі, який переобладнали у тимчасову палату для пацієнтів з Covid-9. (Експрес-фото: Аміт Мехра) Під час зустрічі з районними лабораторіями в Махараштрі минулого тижня Національний інститут вірусології (NIV) поділився обмеженими даними, які показують розбивку 361 зразка із секвенуванням геному, зібраного в період із січня по березень цього року.
Висновок заголовка з аналіз : наявність подвійної мутації виявлено у 220 — майже 61% — зразків. Минулого тижня цей подвійний варіант був класифікований як варіант B.1.617.
Інформаційний бюлетень| Натисніть, щоб отримати найкращі пояснення за день у папку 'Вхідні'.
Що таке B.1.617?
Варіант B.1.617 SARS-CoV-2 містить дві мутації: E484Q та L452R. Обидва окремо зустрічаються в багатьох інших варіантах коронавірусу, але вперше про них повідомили разом в Індії.
Дві мутації виявлені в шиповому білку вірусу. Спайк-білок допомагає вірусу зв’язуватися з рецепторами людської клітини і проникати в клітину-хазяїна.
Мутація E484Q подібна до E484K, мутації, знайденої у варіантах коронавірусу у Сполученому Королівстві (лінія B.1.1.7) та Південній Африці (B.1.351).
Мутація L452R була виявлена у швидкопоширюваних варіантах у Каліфорнії (B.1.427 та B.1.429). Він може підвищити силу зв’язування білків-шипів з рецепторами ACE2 на клітинах людини, що робить його більш переданим. L452R також потенційно може посилити реплікацію вірусу.
Разом E484Q і L452R є більш заразними і можуть уникати антитіл.
Де було знайдено B.1.617?
Є обмежені дані. Про це вперше повідомили з Махараштри. У січні було секвеновано 19 зразків з різних районів, у чотирьох виявлено B.1.617. У лютому було секвеновано 234 зразки з 18 районів, а 151 зразок — щонайменше з 16 районів — мав цей варіант. А в березні це було аж у 65 із 94 зразків.
Наразі райони Амраваті, Нагпур, Акола, Варда, Пуна, Тане, Аурангабад і Чандрапур представили переконливі докази наявності B.1.617. В інших районах було секвеновано менше зразків, а в деяких був знайдений варіант. Очікується секвенування для додаткових зразків.
ПРИЄДНУЙСЯ ЗАРАЗ :Телеграм-канал Express пояснив
Чи є цей варіант більш шкідливим?
Доказів поки що немає. Більшість пацієнтів можуть обійтися домашньою ізоляцією, хоча клінічний досвід необхідно об’єднати з даними секвенування геному, щоб отримати наукові докази. Клінічні анекдоти лікарів говорять про те, що цей варіант поширюється швидше, є більш заразним, може вражати цілі сім’ї, але є менш вірулентним і не викликає значно більше госпіталізацій.
Більшість пацієнтів протікають безсимптомно, і це є хорошим показником. Але в абсолютних цифрах так багато випадків накладають тягар на інфраструктуру охорони здоров’я, сказав д-р Шашанк Джоші, експерт Робочої групи по COVID-19 Махараштри.
Наскільки він поширився?
Доктор Суджит Сінгх, директор Національного центру з контролю за захворюваннями (NCDC), зазначив, що наразі було секвеновано дуже мало зразків з Махараштри, і ще зарано робити остаточні висновки про те, наскільки поширений подвійний мутант. Однак центральний уряд повідомляв у березні, що 15-20% зразків у Махараштрі мають цей варіант; на основі останніх даних секвенування ми знаємо, що зараз це число перевищує 60 відсотків.
Лікарі та районні адміністратори в Махараштрі повідомляють, що на відміну від першої хвилі, у другій хвилі інфікуються цілі сім’ї. Це може свідчити або про те, що заходи фізичного дистанціювання та ізоляції є недостатніми в домогосподарстві, або що вірус став більш переданим.
Чи може B.1.617 спричинити триваючий сплеск випадків Covid-19?
Доктор Гангандіп Кан, професор мікробіології Християнського медичного коледжу, Веллор, сказав, що 60,9% зразків, які несуть цей варіант, швидше за все, показали зв'язок між мутацією і сплеском, однак для точної відповіді принаймні 1% зразків Covid-19 слід проводити щотижня. Зараз Індія тестує понад 1000 випадків щодня, і це означає приблизно 1000 послідовностей геному щодня.
Нам також потрібно подивитися, скільки людей людина здатна заразити, і поріг циклу RT-PCR. Нам потрібно відстежувати в реальному часі. За словами д-ра Кан, дані за січень мало цінні в квітні.
Доктор Гаутам Менон, професор Університету Ашоки, Сонепат, та Інституту математичних наук у Ченнаї, сказав: «Те, що ми маємо, є нагадливим, але нам потрібно більше даних про секвенування геному, щоб зрозуміти, який варіант викликає кількість нових інфекцій у різних штатах… Щоб припустити, що зростання випадків пов’язано з цим подвійним мутантним варіантом, ми повинні мати більше часових точок. Наприклад, якщо ми могли б сказати, що ми виявили 30 відсотків цього варіанту в пробах 30 березня, а потім 40 відсотків у пробах 14 квітня, це означало б, що новий варіант домінує у поширенні хвороби.
Доктор Менон також підкреслив необхідність більшої прозорості даних. За його словами, можливе, хоча і все більш малоймовірне, що випадки можуть бути пов’язані з попереднім штамом. Якщо ми не знаємо, якою мірою збільшення можна віднести до нового варіанту, ми не зможемо остаточно визначити, чи послаблення відповідної Covid поведінки зі старшим штамом призвело до збільшення, чи є причиною збільшення інфекційності нового варіанта.
Професор Вінод Скарія, провідний науковець CSIR-IGIB, погодився, що ми не можемо однозначно сказати, що ці варіанти викликають сплеск другої хвилі. Однак дані свідчать про те, що принаймні в деяких штатах родовід B.1.1617 є переважаючим і може сприяти зростанню випадків, сказав він. Ця лінія визначається 15 генетичними варіантами, включаючи шість варіантів білка шипа. Два з них (E484Q і L452R) беруть участь у імунній втечі, а також у підвищенні інфекційності, сказав професор Скарія.
Чи може цей варіант уникнути вакцин?
Знову ж таки, дані обмежені. Деякі люди дійсно були інфіковані після першої дози, але немає даних про те, чи були їхні зразки відправлені на секвенування геному.
Ми знаємо, що південноафриканський варіант більш здатний уникнути імунної відповіді. Ми знаємо, що британський варіант є найбільш переданим. Але поки що ми нічого не знаємо про B.1.617, тому що ми не збираємо дані, щоб робити висновки, сказав д-р Кан.
Доктор Менон підкреслив, що, хоча вакцини не повинні запобігати зараженню, вони, безумовно, запобігають важким захворюванням і смерті. Ми очікуємо, що це залишиться так і з новим варіантом. Єдиним середньо- та довгостроковим рішенням боротьби з Covid-19 є вакцинація людей.
Поділіться Зі Своїми Друзями:
