Пояснення: що таке нова підлінія AY.12 варіанту Delta, і чи варто вас хвилювати?

Варіант Delta (B.1.617.2) породив кілька підліній, які називаються варіантами «Delta Plus», які несуть більшість його характерних мутацій, але відрізняються іншими способами. Одна з цих підліній, AY.12, має всі характерні дельта-мутації, крім однієї.

Люди стоять у черзі, щоб отримати дозу вакцини від Covid-19 у тимчасовому центрі вакцинації, створеному в школі в Мумбаї, у вівторок, 17 серпня 2021 р. (PTI Photo/Kunal Patil)

Оскільки світ нервово відстежує всі нові варіанти Covid-19 та його підлінії, кожен зразок вірусу технічно є новим «варіантом», оскільки його послідовність не збігається з послідовністю будь-якого іншого вірусу.

Тепер вчені розширили сімейство Delta з чотирьох до 13 варіантів. Деякі випадки Дельта варіант , найпоширеніший варіант занепокоєння в Індії, перекласифікуються в інший підліній — AY.12 — який був пов’язаний з великою кількістю випадків в Ізраїлі, консорціум індійського геному SARS-CoV-2 (INSACOG), яка відстежує нові варіанти, йдеться у звіті.

Однак, оскільки визначення AY.12 є суперечливим, остаточні числа потребують певного часу, йдеться у заяві консорціуму.

Отже, що це за мутація AY.12?

По суті, вірусна еволюція працює як будь-який інший вид. Поширюючись по організму, вірус робить себе копії, які часто мають невеликі помилки та зміни.

Таким чином, варіант Delta (B.1.617.2) породив кілька підліній, які називаються варіантами «Delta Plus», які несуть більшість його характерних мутацій, але відрізняються іншими способами. Одна з цих підліній, AY.12, має всі характерні дельта-мутації, крім однієї.

Сплеск випадків захворювання в Ізраїлі викликає занепокоєння, оскільки це країна, в якій майже 60% дорослих людей повністю вакциновані, і повідомляє, що ефективність вакцини Pfizer у цій країні значно нижча, ніж те, що було виявлено під час клінічних випробувань. Рекласифікація в першу чергу спрямована на сприяння мікроепідеміології і не ґрунтується на отриманні значних мутацій. Таким чином, наразі не відомо, чи AY.12 клінічно відрізняється від Delta, зазначається у звіті INSACOG. Жодних нових мутацій, що викликають занепокоєння, у білку спайка (S) не відмічено. Однак його швидке зростання в Ізраїлі означає, що його слід вивчати далі.

Чи є різниця між AY.12 та іншими штамами?

За даними INSACOG, поки невідомо, чи AY.12 клінічно відрізняється від Delta чи B.1.617.2.

Однак AY.12 втратив деякі мутації, які спостерігаються в лінії Delta, наприклад G142D в білку спайка. Ніяких нових мутацій, що викликають занепокоєння, не відмічено в білку спайка цього варіанту.

На даний момент AY.12 є найбільш домінуючим штамом в Ізраїлі — 51% досліджених зразків показали поширеність цього варіанту. Виходячи з кількості послідовностей, які досі були завантажені в GISAID індійськими дослідницькими групами, поширеність цього варіанту за останній тиждень зросла до понад 20 відсотків.

Просячи штатів бути обережними та звернути увагу на цей варіант, INSACOG сказав: AY.12, перепризначений підліній Delta спостерігається у багатьох штатах, але цифри потребують більш детального вивчення. Функціональний вплив змін між Delta і AY.12 невідомий, але вони, схоже, дуже схожі на молекулярному рівні.

Наразі, за даними INSACOG, близько 70 000 зразків коронавірусу були секвеновані на предмет їх геномної структури, з яких 50 000 були віднесені до різних ліній. Близько 60% з них складаються з міжнародних варіантів, що викликають занепокоєння або інтересу (VoC або VoI), які відстежуються в усьому світі та пов’язані зі спалахами, а також випадками прориву вакцини та повторних інфекцій. У межах цих VoC варіант Delta включає 70% зразків. Випадки Delta plus, до яких включено AY.12, лише номер 67, хоча очікується, що після рекласифікації це збільшиться.

Відстеження еволюції

Outbreak.org, який відстежує нові варіанти та їх поширеність, стверджує, що перший випадок лінії AY.12 був зафіксований 7 вересня 2020 року. З того часу до серпня у світі було виявлено 44 083 послідовності в лінії AY.12. 26

Однак цей варіант вийшов на перший план після того, як став домінуючим штамом в Ізраїлі. Четверта хвиля інфекцій швидко наближається до рівня найгірших днів пандемії в Ізраїлі минулої зими. Щоденний рівень підтверджених нових випадків вірусу зріс більш ніж вдвічі за останні два тижні, що робить Ізраїль зростаючою гарячою точкою в міжнародних чартах. Обмеження на збори, комерційні та розважальні заклади були відновлені цього тижня, і уряд розглядає можливість нового блокування.

Однак більшість експертів стурбовані тим, що високий рівень інфікування в Ізраїлі серед ранніх одержувачів вакцини може свідчити про ослаблення захисту вакцини з часом, висновок, який сприяв рішенню США почати широко пропонувати ревакцинацію американцям, починаючи з наступного. місяць. Вакцина може бути менш ефективною для запобігання зараженню висококонтагіозним варіантом A.12 Delta, який зараз є основною версією вірусу в Ізраїлі.

Дані, опубліковані Міністерством охорони здоров’я Ізраїлю наприкінці липня, свідчать про те, що укол Pfizer був лише на 39% ефективним проти зараження в країні наприкінці червня та на початку липня, у порівнянні з 95% у січні до початку квітня. Проте в обох періодах укол був більш ніж на 90% ефективним у запобіганні важких захворювань. Таким чином, Ізраїль зараз покладає свої надії на прискорювальні постріли.

За даними Outbreak.org, перший зразок AY.12 в Індії датується 7 вересня 2020 року.

Наразі INSACOG секвенував 67 699 зразків вірусу з Індії, з яких 50 869 були детально проаналізовані. Додаткові 11 016 послідовностей зразків були надані урядами штатів, в результаті чого загальна кількість секвенованих зразків склала 78 865.

Однак тривожна тенденція полягає в тому, що, оскільки в Індії наразі було інфіковано понад 3,2 мільйона людей, на сьогоднішній день секвеновано лише близько 0,002% зразків.

Що важливо для звичайних людей?

Не всі варіанти, визнані Всесвітньою організацією охорони здоров’я, однаково погані. Коли організація дає назву новій родині, вона також додає ярлик, який говорить нам про те, як ми повинні хвилюватися.

Найнижчий рівень – це варіант, який цікавить, а значить, за ним варто стежити. Посередині є варіант занепокоєння, як-от Delta, який перетворився на більш небезпечний. Часто варіанти, які цікавлять, мають таку мітку, оскільки вони мають спільну мутацію з варіантами, що викликають занепокоєння,— вони під наглядом. CDC має додаткову, більш сувору категорію, варіант високої тяжкості, який ніколи не був наданий родині Covid. Він зарезервований для потенційних майбутніх штамів, які можуть спричинити серйозні захворювання у вакцинованих людей, не виявлятися в широко використовуваних діагностичних тестах або, можливо, протистояти багаторазовому лікуванню симптомів COVID.

Мутації відбуваються випадковим чином у геномах вірусів у всіх мільйонів інфікованих людей. Деякі з цих мутацій відмирають, а деякі поширюються на інших людей. Таким чином, вчені уважно стежать за закономірностями в Дельті, особливо, оскільки вона поширюється так швидко.

Інформаційний бюлетень| Натисніть, щоб отримати найкращі пояснення за день у папку 'Вхідні'.

Поділіться Зі Своїми Друзями: